Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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