Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP36Q96G28 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms