Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELP4Q96EB1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms