Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms