Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms