Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms