Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms