Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms