Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG16L2Q8NAA4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms