Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms