Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms