Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms