Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms