Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms