Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms