Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF880Q6PDB4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms