Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms