Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf84Q5VXU9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms