Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms