Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms