Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
L1TD1Q5T7N2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms