Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLFNL1Q499Z3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFNL1Q499Z3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms