Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms