Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms