Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC142Q17RM4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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