Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CDO1Q16878 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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