Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRNQ16849 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRNQ16849 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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