Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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