Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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