Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TNXAQ16473 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNXAQ16473 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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