Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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EXT1Q16394 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXT1Q16394 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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