Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms