Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms