Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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NCOA1Q15788 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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NCOA1Q15788 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA1Q15788 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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NCOA1Q15788 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
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NCOA1Q15788 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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NCOA1Q15788 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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NCOA1Q15788 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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NCOA1Q15788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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