Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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