Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP10Q15642 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms