Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SF1Q15637 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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