Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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