Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms