Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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