Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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