Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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