Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3AQ14152 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms