Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM29Q14134 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms