Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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