Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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