Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL1Q13616 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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