Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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