Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms