Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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